泰星人开始将泰星多维飞行用于人类普通消费者。聋哑儿童吉米·西姆斯和他的妈妈安娜参加泰星多维飞行从洛杉矶前往纽约。他们从洛杉矶的“入口”系统进入,但是旅途中出了意外,吉米失踪了,只有安娜独自到达了纽约。布恩和桑德沃前来帮助这个已经歇斯底里的母亲,并负责找回她的儿子。他们清楚的知道,如果安娜把这次事故告诉媒体,这里将变得更加歇斯底里。沃肯博士是负责入口系统的科学家,他似乎对于吉米的失踪身心疲惫。就在桑德沃威胁安娜要保持沉默的时候,吉米突然出现在机场,他有些搞不清方向,但是没有受伤。突然吉米能够听见,也能够讲话了,当他喊他的妈妈的时候,所有的人都被震惊了。
由于人们目击了吉米的失踪和再次出现,泰星发展会知道他们面临着被曝光的危险。大安佐阿知道泰星人向人类提供 泰星多维飞行服务的真正原因,他们在 泰星多维飞行中途停顿的时候挑选人类进行试验和授精。 泰星发展会支持佐阿对此事的处理,但是大安对于盟友的这一次的处理表示严重忧虑。
同时,布恩带着吉米去找 抵抗运动的合作者克里斯汀·帕克博士,对吉米的身体进行检查。帕克博士发现吉米被植入了不完全的CVI ,能量刚好能够恢复他的听力和语言能力,布恩意识到泰星人在收集人类进行试验。
出人意料的是,布恩的妹妹莎拉在一次身体检查的时候,被宣布怀孕三个月。当布恩得知莎拉曾经参加过 泰星多维飞行以后,他立刻警觉起来。莎拉的怀孕是以前的自然受孕,还是泰星人使她受精?在布恩从沃肯博士那里得到答案以前,他发现博士自杀了。
事实上,因为沃肯博士准备向公众公开泰星人的阴谋,桑德沃和他的人杀了沃肯。布恩和莉莉一起,找到了沃肯博士隐藏的记录,没有授权进入 泰星多维飞行的机场。和多尔斯、 占卜交换过意见以后, 抵抗运动同意让科学家萨吉特去做一个诱饵。因为萨吉特的智商很高,所以他们确信萨吉特会被泰星人选中,从而渗透进入这个项目。与此同时,布恩让莎拉去找帕克博士,检查她的怀孕是否和泰星人有关。帕克博士给萨吉特安装了跟踪装置,这样 抵抗运动能够在 泰星多维飞行的全过程中知道萨吉特究竟去了哪里,并且萨吉特能够在旅途中保持清醒。
和事先预料的一样,萨吉特被泰星人选中了,他被带到一个秘密实验室,在这里他看了其他一些人类被处在休眠状态,从而让泰星人在他们身上进行研究。萨吉特惊恐的发现,自己和 抵抗运动之间已经联系不上了,他处在一个离奇的环境,完全的孤立。与此同时,帕克博士通知莎拉,她没有三个月的身孕,但是曾经在她的传输过程中被放置过一个快速发育的胎儿。莎拉接受不了这样的打击,离开了。为了找到妹妹,布恩来到了机场。在那里,他遇到桑德沃,桑德沃收到报警,泰星人的一个试验样品出了问题。他们来到了泰星实验室,布恩和桑德沃惊恐的看到了几十个人类试验样品,在其中包括布恩的妹妹莎拉。佐阿证实了莎拉曾经被植入过泰星生物技术制造的胎儿,布恩不得不假装对此毫无兴趣,同时还需要救莎拉和萨吉特。他的努力失败以后,莎拉突然消失在机场。
萨吉特发现了泰星实验室实际上位于月球,但是被桑德沃逮捕了他。他被带到泰星总部,在那里他被桑德沃、佐阿和大安审问。泰星人发现了萨吉特与 抵抗运动和多尔斯之间的联络装置,萨吉特拒绝合作。他被佐阿送回到泰星实验室,继续接受审问。
无人察觉的情况下,大安在萨吉特的脖子后面放置了一个微型装置。尽管一组 抵抗运动成员试图营救萨吉特,桑德沃还是把他拽进了 泰星多维飞行。但是在旅途的终点,桑德沃发现他自己只身位于泰星实验室,萨吉特不见了。a萨吉特神秘的安全抵达洛杉矶,经过检查, 抵抗运动发现了大安秘密放置在萨吉特身上的装置。布恩和莉莉认为大安故意在萨吉特身上放置这个装置,这样他在通过机场的时候,能够伪装基因代码,从而逃走。
莉莉在洛杉矶的医院里找到了莎拉,布恩担心妹妹的健康,把她交给了帕克博士,帕克确信她已经失去了她的孩子。布恩现在意识到这个胎儿在处于休眠状态的时候,被取走了。和妹妹告别以后,布恩知道自己并没有完全使妹妹相信她的怀孕,是泰星试验的一部分。
布恩继续了解更多的泰星秘密,他再一次遇到了吉米,吉米已经开始享受他的听力和语言能力。作为盟友计划的一部分,吉米登记进入泰星科学学院进行学习。尽管吉米从泰星人的试验中获益,布恩仍旧深深的为那些曾经参加过 泰星多维飞行的人的未来感到忧虑。